สายการบินจดทะเบียนในประเทศของปานามา Copa Airlines (CM) มีฐานอยู่ในเมืองปานามา สายการบินนี้ ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของพันธมิตร Star Alliance ให้บริการเที่ยวบินแบบไม่หยุดพักไปยังจุดหมายปลายทาง 70 แห่งใน 30 ประเทศในอเมริกากลาง, อเมริกาเหนือ, อเมริกาใต้ และแคริบเบียน ฝูงบินเป็นเครื่องบินแบบสองห้องโดยสาร ได้แก่ ชั้นธุรกิจและชั้นประหยัด ศูนย์การบินตั้งอยู่ที่ท่าอากาศยานนานาชาติ Tocumen (PTY) ในเมืองปานามา ส่วนเมืองสำคัญประกอบด้วยท่าอากาศยานนานาชาติ El Dorado (BOG) ในเมือง Bogota, ท่าอากาศยานนานาชาติ La Aurora (GUA) ในเมืองกัวเตมาลา, San Jose, ท่าอากาศยานนานาชาติ Juan Santamaría (SJO) ในคอสตาริกา และท่าอากาศยานนานาชาติ Augusto C. Sandino (MGA) ในมานากัว