เป็นพิพธภัณฑ์อยู่ด้านหน้าสวนอุเอโนะ พอเดินชมสวยเสร็จยังเหลือเวลาอีกเลยลองเข้าไปชม ที่สะดุกตาก่อนเข้าชมจะมีปลาวาฬตัวใหญ่ด้านหน้า มันใหญ่มากๆ และด้านข้างก็จะมีหัวรถจักรไอน้ำอีกด้วย การได้เข้าไปขมที่นี่ทำให้ได้ความรู้เรื่องของประเทศญี่ปุ่นมากมาย

พิพิธภัณฑ์วิทยาศาสตร์ธรรมชาติแห่งนี้ ตั้งอยู่ในสวน Ueno Park ด้านหลังพิพิธภัณฑ์ศิลปะ ไม่ไกลจากทางเข้าสวยสัตว์ Ueno เป็นสถานที่ให้ความรูทางด้านวิทยาศาสตร์ที่ดีมากๆ ดีทั้งในแง่ตัวนิทรรศการให้ความรู้ที่ออกแบบมาเป็นอย่างดี และในด้านการบริหารจัดการ มีสิ่งอำนวยความสะดวกที่จัดไว้อย่างเหมาะสม และมีตู้ locker สำหรับฝากของ แนะนำมากๆ โดยเฉพาะสำหรับครอบครัวที่พาเด็กๆ ไปเที่ยวด้วย ควรพาลูกๆ แวะไปชม เป็นแหล่งเรียนรู้และกระตุ้นให้เด็กสนใจวิทยาศาสตร์ที่ดีมาก ควรเผื่อเวลาในการเยี่ยมไว้สัก 3 ชั่วโมง

ตัวพิพิธภัณฑ์แบ่งออกเป็น 2 อาคาร คือ Global และ Japan กับอีก 1 โซนนิทรรศการพิเศษ ซึ่งทั้งสองอาคารสามารถเข้าได้ทั้งหมดหลังเสียค่าผ่านประตูไปแล้ว จะมียกเว้นแค่โซนนิทรรศการพิเศษที่ต้องเสียค่าผ่านประตูเพิ่ม แต่น่าเสียดายว่าช่วงที่ไปครั้งล่าสุด มีการปิดปรับปรุงไปอยู่หลายส่วน ซึ่งจะกลับมาเปิดเต็มรูปแบบช่วงเดือนกรกฎาคม แต่ส่วนที่เปิดบริการที่เหลืออยู่ทั้งหมด ก็ยังเยอะและควรค่าก็แก่การเยี่ยมชม คุ้มค่าจนไม่รู้สึกเสียดายค่าผ่านประตูเลย

อยู่ในบริเวณสวนUeno มีของให้ดูเยอะพวกฟอสซิล สัตว์สตาฟ มีส่วนที่เป็นโรงหนัง4มิติ เกี่ยวกับเรื่องอวกาศดีมาก ไม่ควรพลาด(มีแต่เสียงภาษาญี่ปุ่น) ปิดวันจันทร์