เป็นระบบรถไฟฟ้าที่วิ่งในเขตโตเกียว มีหลายสายเช่น สาย ginza ,สาย Hibiya เป็นต้น ซึ่งแต่ละสายสามารถเดินทางไปเที่ยวสถานที่สำคัญภายในโตเกียวได้อย่างทั่วถึง หากเดินทางไปหลายสถานที่แนะนำให้ซื้อเป็นตั๋วแบบ 1 day จะคุ้มค่ากว่าซื้อแบบเที่ยว

การเดินทางในมหานครโตเกียวมีหลายประเภทและราคาค่อนข้างสูง ทว่าระบบขนส่งรถไฟใต้ดินเป็นวิธีการเดินทางที่ค่อนข้างสะดวกและจะประหยัดมากสำหรับนักท่องเที่ยวที่พึงเดินทาง1-3 วันติดต่อกัน สามารถผ่านเข้าออกสถานีซับเวย์ทั้งโทเอและเมโทรไม่จำกัดครั้ง เพียงใช้บัตรโดยสารพิเศษเฉพาะนักท่องเที่ยวซึ่งจำหน่ายที่ท่าอากาศยานนานาชาตินาริตะและฮาเนดะ รวมถึงห้างบิ๊กคาเมร่าบางสาขา สนนราคา หนึ่งวัน 800 เยน สองวัน 1200 เยน สามวัน 1500 เยน

รถไฟใต้ดินค่อนข้างมาถี่ 3-5 นาทีก็มา ไม่หนาแน่นอึดอัดเท่ารถไฟบนดินของเจอาร์ อย่างไรก็ดี สถานีร่วมบางเส้นทางอาจเดินไกลเกือบหนึ่งกิโลเมตรแต่ก็สะดวกสบายเพราะมีทางเชื่อมใต้ดินปรับอากาศเย็นฉ่ำ น้อยสถานีที่จะต้องใช้เส้นทางเรียบถนน ที่สำคัญแต่ละสถานีมีเจ้าหน้าที่อำนวยความสะดวก ช่วยเหลือนักท่องเที่ยวเป็นภาษาอังกฤษและบริการแผนที่ย่านที่ตั้งของสถานีฟรี เมื่อขึ้นมาพื้นดินก็ยังมีแผนที่บอกตำแหน่งให้นักท่องเที่ยวทราบอีก ต่างจากรถไฟเจอาร์ ไม่มีแผนที่บริการ เจ้าหน้าที่ได้แต่อธิบายทางให้แค่นั้น